Modo de Juego
Tiene todos los personajes del primer Ninja Destiny, junto con los personajes de Naruto: Shippūden. Una versión con todos los elementos removidos de la segunda parte fue lanzado en Europa bajo el título de "Naruto: Ninja Destiny 2".
Personajes
Deidara
Gaara (jugable con la apariencia de las partes I y II)
Itachi Uchiha
Jiraiya
Kabuto Yakushi
Kakashi Hatake
Kisame Hoshigaki
Naruto Uzumaki (jugable con la apariencia de las partes I y II; también jugable en Modo Kyubi, Modo Una Cola y Modo Cuatro Colas)
Neji Hyūga (jugable con la apariencia de las partes I y II)
Orochimaru
Rock Lee (jugable con la apariencia de las partes I y II)
Sai
Sakura Haruno (jugable con la apariencia de las partes I y II)
Sasori
Sasuke Uchiha (jugable con la apariencia de las partes I y II; también jugable en Modo Sello Maldito)
Shikamaru Nara (jugable con la apariencia de las partes I y II)
Temari (jugable con la apariencia de las partes I y II)
Tsunade
Yamato
